Fiskeristyrelsen foretager en række kontroller med fiskeri.
Hygiejnekontrollen udføres af hensyn til fødevaresikkerheden, og omfatter blandt andet kontrol ombord på fartøjer ved landinger af fisk.
Reglerne for, hvilke redskaber, der må anvendes til fiskeri i de enkelte farvande, er nøje tilpasset det enkelte farvand og det enkelte fiskeri.
Fiskeristyrelsen har forskellige projekter med elektronisk monitorering.
En række af de centrale arter i dansk fiskeri er omfattet af et særligt kontrol- og inspektionsprogram, hvor der i EU-reglerne er specifikke krav til kontrolindsatsen.
Årsrapporterne præsenterer hovedresultaterne af styrelsens kontrolindsats i de enkelte år baseret på den udførte kontrol af styrelsens enheder.
Prøvetagnings- og kontrolplanerne stiller en række krav til erhvervet og skaber samtidig nogle muligheder, som ikke vil være til stede uden planerne.